สรุปผลการจับสลากโตโยต้า ลีกคัพ รอบ 16 ทีมสุดท้าย ฉลามชลแม้จะจับสลากได้สิทธิ์เป็นเจ้าบ้านแต่ก็เจองานหนักรับมือ ศรีสะเกษ เอฟซี
เมื่อวันที่ 10 มิถุนายน ที่โรงแรมดิเอมเมอรัลด์ รัชดา ได้มีการจับสลากประกบคู่โตโยต้า ลีกคัพ 2016 รอบ 16 ทีมสุดท้าย ซึ่งในรอบนี้ทีมจากดิวิชั่น 2 และ ดิวิชั่น 1 ยังได้สิทธิ์เล่นในบ้านต่อไป แต่จะมี 1 ทีมจากโตโยต้า ไทยลีก ที่ต้องสลากไปอยู่ฝั่งเจ้าบ้านเพื่อให้ครบทีมวาง ก่อนจะเป็น ชลบุรี เอฟซี ที่โชคดีไปซึ่งจะแข่งขันในระบบน็อคเอาท์
โตโยต้า ลีกคัพ รอบ 32 ทีมเพิ่งแข่งขันจบไปเมื่อวันที่ 8 มิถุนายน ซึ่งเหลือ 9 ทีมจากโตโยต้า ไทยลีก ที่ผ่านมาเข้ามานำโดยแชมมป์เก่า บุรีรัมย์ ยูไนเต็ด , เมืองทอง ยูไนเต็ด , ชลบุรี เอฟซี ,พัทยา ยูไนเต็ด ,บีอีซี เทโรศาสน, แบงค็อก ยูไนเต็ด ,โอสถสภา,ศรีสะเกษ เอฟซี และ สุโขทัย เอฟซี พร้อมด้วย 5 ทีมจากดิวิชั่น 1 อุบล ยูเอ็มที ,ลำปาง เอฟซี, กระบี่ เอฟซี, การท่าเรือ เอฟซี และ สงขลา ยูไนเต็ด รวมถึง 2 ทีมจากดิวิชั่น 2 ที่หลงเหลืออยู่อย่าง ม.เกษตรศาสตร์ และ ตาก ซิตี้
ขณะที่ผลการจับสลากรอบ 16 ทีมสุดท้ายมีดังนี้ (แข่งขัน 6 กรกฎาคม 2559)
ตาก ซิตี้ (ด.2) - แบงค็อก ยูไนเต็ด (ไทยลีก)
ลำปาง เอฟซั (ด.1) - พัทยา ยูไนเต็ด (ไทยลีก)
สงขลา ยูไนเต็ด (ด.1) - โอสถสภาฯ (ไทยลีก)
กระบี่ เอฟซี (ด.1) - สุโขทัย เอฟซี (ไทยลีก)
การท่าเรือ เอฟซี (ด.1) - บีอีซี เทโรศาสน (ไทยลีก)
ม.เกษตรศาสตร์ เอฟซี (ด.2) - บุรีรัมย์ ยูไนเต็ด (ไทยลีก)
อุบล ยูเอ็มที (ด.1) - เมืองทอง ยูไนเต็ด
ชลบุรี เอฟซี (ไทยลีก) - ศรีสะเกษ เอฟซี (ไทยลีก)
สำหรับ ศึกโตโยต้า ลีกคัพ ตั้งแต่รอบ 64 ทีมถึงรอบ 8 ทีมจะแข่งขันระบบน็อคเอ้าท์ ส่วนรอบรองชนะเลิศจะแข่งขันเหย้า-เยือน เพียงรอบเดียว โดยทีมชนะเลิศจะได้รับเงินรางวัล 5 ล้านบาท พร้อมสิทธิ์ในการแข่งขันโตโยต้า แม่โขงคลับ แชมเปี้ยนชิพ 2016 ในรอบชิงชนะเลิศ และ โตโยต้า พรีเมียร์คัพ 2016